Il museo è stato fondato nel 1946 in seguito alla donazione del castello e delle terre da parte del conte di Plymouth.[6] Ha aperto le sue porte al pubblico nel 1948, sotto il nome di Welsh Folk Museum. Il nome del museo in gallese (che significa anche "Welsh Folk Museum") è rimasto invariato da quella data, mentre il titolo inglese è stato rivisto in Museum of Welsh Life, in seguito St Fagans National History Museum, e di nuovo con il titolo attuale.[2] [7]
Nato da un'idea di Iorwerth Peate, il museo è stato modellato su Skansen, il museo all'aperto dell'architettura vernacolare svedese a Stoccolma. La maggior parte delle strutture ricostruite a Skansen sono state costruite in legno e quindi sono facilmente smontabili e rimontate, ma un museo simile in Galles sarebbe stato più ambizioso, poiché gran parte dell'architettura vernacolare del Galles è fatta di muratura.[3][ 6]
ristrutturazione 2017 Nel luglio 2017 è stato inaugurato un edificio principale ristrutturato.[8] La riqualificazione del sito, durata sei anni e del valore di 30 milioni di sterline, finanziata da diverse fonti, in particolare dal governo gallese e dalla lotteria nazionale, è stata completata nell'ottobre 2018.[9][10]
Il progetto di riqualificazione da 30 milioni di sterline ha fornito molti vantaggi, tra cui tre nuove gallerie che mostrano la storia del Galles, miglioramenti a edifici come la fattoria dell'età del ferro, Bryn Eryr e la corte del principe medievale e Llys Llywelyn, nonché un edificio d'ingresso principale ristrutturato e un nuovo ristorante, un'area giochi e spazi di apprendimento.[11] Uno dei nuovi edifici, il Gweithdy ("laboratorio"), presenta strumenti dell'età della pietra e sedie a bastoni.[12]
Nel giugno 2019, St Fagans è stato nominato Museo dell'anno 2019 del Regno Unito dall'Art Fund, che ha elogiato "l'immaginazione, l'innovazione e i risultati eccezionali" della struttura.[13] L'Art Fund è un ente di beneficenza che aiuta a sostenere musei e gallerie.[14]