Die Kirche wurde 1410 von Mykolas Gintilavičius-Gentvila im Auftrag von Fürst Vytautas dem Großen errichtet. Im Jahr 1445 wurde sie mit einer Pfründe ausgestattet (später wurde sie von Giedraičiai gestiftet). Der Pfarrer besaß die Gerichtsbarkeit über die Stadt, 8 Dörfer und 3 Seen. Im Jahr 1542 wurde die hl. Der Altar von St. Anna wurde 1542 errichtet.
Im Jahr 1655 wurde die Kirche von russischen Soldaten niedergebrannt, 1676 gab es noch eine provisorische Kirche. Im Jahr 1725 wurde die Bruderschaft des Heiligen Rosenkranzes gegründet. In den Jahren 1777-1782 wurde eine Pfarrschule eröffnet.
Im Jahr 1809 errichteten der Bischof von Samogitia, Juozapas Arnulfas Giedraitis, und sein Bruder Martynas die heutige Backsteinkirche. Laut dem Testament des Bischofs ist nach seinem Tod (1838) sein Herz in die Wand des Presbyteriums eingelassen; ein Porträt des Gründers hängt in der Sakristei. Im Jahr 1893 war Polnisch die Sprache der Kirche, aber es wurde auch auf Litauisch gepredigt. Ab 1903 wurden die Gottesdienste in litauischer Sprache abgehalten, und es wurde ein litauischer Kirchenchor gegründet. Im Jahr 1911 störten Polen die litauischen Gottesdienste in der Kirche. In den Jahren 1912-1913 wurden Aufrührer vor Gericht gestellt. In den Jahren 1912-1914 gab es eine Zweigstelle der Litauischen Katholischen Nüchternheitsgesellschaft, die am 29. Juni 1913 gegründet wurde. Das erste öffentliche litauische Theaterstück wurde am 19. Juni 1917 in Giedraitis aufgeführt.
Am 24. August 1919 störten die Polen einen litauischen Gottesdienst, verhöhnten den Pfarrer, terrorisierten ihn und verschleppten ihn aus Giedraičiai. 1949 wurde der Pfarrer Kazimieras Liesevičius (1883-1963) verhaftet und zu 10 Jahren Gefängnis verurteilt. Er kehrte 1955 nach Litauen zurück (Übersetzt aus Wikipedia).